KudoZ question not available

Russian translation: вариабельный геном

GLOSSARY ENTRY (DERIVED FROM QUESTION BELOW)
English term or phrase:accessory genome
Russian translation:вариабельный геном
Entered by: Natalie

06:51 Oct 25, 2015
English to Russian translations [PRO]
Science - Genetics / phylogenetics
English term or phrase: accessory genome
From "Horizontal gene transfer: building the web of life" by Soucy et al., 2015:
http://www.nature.com/nrg/journal/v16/n8/full/nrg3962.html
======================================
The comparison of genomes from closely related organisms has identified large variation in gene content within a single species, especially in prokaryotic species. This variation in genome content reflects the ongoing process of gene gain and loss. Pan-genomes have been useful for studying the evolution of gene content in both prokaryotic species and genera. The pan-genome is defined as the set of all genes present in a taxon; the accessory genome contains genes that are present in only one or a few members of the taxon; and the core genome is the set of genes present in every member of the taxon.
Artyom Timeyev
Russian Federation
Local time: 15:22
геном периферии
Explanation:
филогенетика

Начиная с 60-х гг. ХХ столетия в филогенетике всё большее значение приобретает изучение молекулярных структур. Получение технического доступа к первичной структуре информационных макромолекул и возможность сравнения организмов по этим последовательностям было расценено как «молекулярная революция» в филогенетике. Она породила молекулярную филогенетику, в котором заключения о кладистической истории выводятся на основании анализа исключительно молекулярных данных. Её новейший этап развития — генофилетика (иногда её называют филогеномикой) — раздел новой филогенетики, связанный с изучением нуклеотидных последовательностей.
http://zmmu.msu.ru/personal/pavlinov/doc/phyl-biol.htm

вспомогательныe геномы содержaт гены, которые присутствуют только в одном или нескольких членов таксона

Пан-геном. (совокупность всех генов бактериального вида).
Для описания генома вида на основании геномных последовательностей его штаммов была предложена концепция пангенома [3, 4]. В этой концепции пангеном – это суммарный набор генов всех штаммов одного бактериального вида (рода).

http://itas2012.iitp.ru/pdf/02.pdf

Пангеном разделяется на три части:
универсальный геном (гены, которые встречаются во всех штаммах таксона)
The pan-genome is defined as the set of all genes present in a taxon,

геном периферии (состоит из генов, которые отсутствуют в одном или более штаммах)
the accessory genome contains genes that are present in only one or a few members of the taxon

и

уникальные (штамм-специфичные) гены [1,3].
and the core genome is the set of genes present in every member of the taxon.



--------------------------------------------------
Note added at 1 hr (2015-10-25 08:06:36 GMT)
--------------------------------------------------

Chitala-iskala pochti chas, ocheny interesno bilo :)
Эволюция бактериальных пангеномов
Е.Н.Гордиенко
Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН, Москва, Россия
[email protected]


--------------------------------------------------
Note added at 2 hrs (2015-10-25 09:22:18 GMT)
--------------------------------------------------

I hope the little owl could help you :) have a nice weekend

--------------------------------------------------
Note added at 3 hrs (2015-10-25 10:36:35 GMT)
--------------------------------------------------

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15990697
The pangenome concept: a unifying view of genetic information.
http://www.medscimonit.com/download/index/idArt/16885

--------------------------------------------------
Note added at 5 days (2015-10-30 07:32:07 GMT) Post-grading
--------------------------------------------------

Спасибо!
Selected response from:

Erzsébet Czopyk
Hungary
Local time: 12:22
Grading comment
Спасибо! Может быть, "вариабельный" и вернее, но мне понравился "геном периферии". (0:
4 KudoZ points were awarded for this answer



Summary of answers provided
4геном периферии
Erzsébet Czopyk
4необязательный/вариабельный/мобильный/пластичный геном
Natalie


  

Answers


1 hr   confidence: Answerer confidence 4/5Answerer confidence 4/5
геном периферии


Explanation:
филогенетика

Начиная с 60-х гг. ХХ столетия в филогенетике всё большее значение приобретает изучение молекулярных структур. Получение технического доступа к первичной структуре информационных макромолекул и возможность сравнения организмов по этим последовательностям было расценено как «молекулярная революция» в филогенетике. Она породила молекулярную филогенетику, в котором заключения о кладистической истории выводятся на основании анализа исключительно молекулярных данных. Её новейший этап развития — генофилетика (иногда её называют филогеномикой) — раздел новой филогенетики, связанный с изучением нуклеотидных последовательностей.
http://zmmu.msu.ru/personal/pavlinov/doc/phyl-biol.htm

вспомогательныe геномы содержaт гены, которые присутствуют только в одном или нескольких членов таксона

Пан-геном. (совокупность всех генов бактериального вида).
Для описания генома вида на основании геномных последовательностей его штаммов была предложена концепция пангенома [3, 4]. В этой концепции пангеном – это суммарный набор генов всех штаммов одного бактериального вида (рода).

http://itas2012.iitp.ru/pdf/02.pdf

Пангеном разделяется на три части:
универсальный геном (гены, которые встречаются во всех штаммах таксона)
The pan-genome is defined as the set of all genes present in a taxon,

геном периферии (состоит из генов, которые отсутствуют в одном или более штаммах)
the accessory genome contains genes that are present in only one or a few members of the taxon

и

уникальные (штамм-специфичные) гены [1,3].
and the core genome is the set of genes present in every member of the taxon.



--------------------------------------------------
Note added at 1 hr (2015-10-25 08:06:36 GMT)
--------------------------------------------------

Chitala-iskala pochti chas, ocheny interesno bilo :)
Эволюция бактериальных пангеномов
Е.Н.Гордиенко
Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН, Москва, Россия
[email protected]


--------------------------------------------------
Note added at 2 hrs (2015-10-25 09:22:18 GMT)
--------------------------------------------------

I hope the little owl could help you :) have a nice weekend

--------------------------------------------------
Note added at 3 hrs (2015-10-25 10:36:35 GMT)
--------------------------------------------------

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15990697
The pangenome concept: a unifying view of genetic information.
http://www.medscimonit.com/download/index/idArt/16885

--------------------------------------------------
Note added at 5 days (2015-10-30 07:32:07 GMT) Post-grading
--------------------------------------------------

Спасибо!

Erzsébet Czopyk
Hungary
Local time: 12:22
Native speaker of: Native in HungarianHungarian
PRO pts in category: 16
Grading comment
Спасибо! Может быть, "вариабельный" и вернее, но мне понравился "геном периферии". (0:
Notes to answerer
Asker: Thank you, Erzsébet!

Login to enter a peer comment (or grade)

3 hrs   confidence: Answerer confidence 4/5Answerer confidence 4/5
необязательный/вариабельный/мобильный/пластичный геном


Explanation:
Я бы предпочла "вариабельный".

Любой из этих синонимов будет в тыщу раз лучше крайне неудачно выбранного в цитируемой выше статье термина "геном периферии" (честное слово, не представляю, чем руководствовался автор статьи при выборе такого термина). Периферия вообще не может иметь никакого генома, т.к. периферия - не живое существо, а край, окраина чего-либо. Полагаю, автор стремился продемонстрировать, что это антоним к "core", т.е. "основной геном", но в таком случае следовало бы написать "периферический".



Вот английское определение, из которого хорошо понятна суть:
_______________________________________
The pangenome is the entire gene set of all strains of a species. It includes both: genes present in all strains (core genome) and genes present only in some strains of a species (variable genome).


Core genome: includes the genes present across all strains of a species. It typically includes housekeeping genes for cell envelope or regulatory functions.

Accessory genome: (also: variable, flexible, dispensable genome) refers to genes not present in all strains of a species. These include genes present in two or more strains and genes unique to single strains, for example, genes for strain specific adaptation such as antibiotic resistance.
http://www.metagenomics.wiki/pdf/definition/pangenome
_______________________________________



--------------------------------------------------
Note added at 5 days (2015-10-30 10:07:25 GMT) Post-grading
--------------------------------------------------

Только, пожалуйста, НЕ ПИШИТЕ "геном периферии"! Это нечто совершенно непонятное, периферия - это "окраина", а окраина не может иметь генома!

Natalie
Poland
Local time: 12:22
Native speaker of: Russian
PRO pts in category: 176
Notes to answerer
Asker: Спасибо за Ваши варианты, Natalie!

Asker: "Только, пожалуйста, НЕ ПИШИТЕ" - Хорошо, не буду.

Login to enter a peer comment (or grade)



Login or register (free and only takes a few minutes) to participate in this question.

You will also have access to many other tools and opportunities designed for those who have language-related jobs (or are passionate about them). Participation is free and the site has a strict confidentiality policy.

KudoZ™ translation help

The KudoZ network provides a framework for translators and others to assist each other with translations or explanations of terms and short phrases.


See also:
Term search
  • All of ProZ.com
  • Term search
  • Jobs
  • Forums
  • Multiple search